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非接触式超声波DNA打断仪实验效果对比分析-人生就是博-尊龙凯时

发布时间:2025-02-24   信息来源:尊龙凯时官方编辑

实验目的:对全基因组DNA样品进行200-500bp区间的均一性片段化处理,以便于 downstream 应用的分析和检测。

非接触式超声波DNA打断仪实验效果对比分析-人生就是博-尊龙凯时

实验仪器及材料:本实验采用三种高效非接触式超声破碎仪器,分别为:小美超声-高通量声波基因组剪切仪、bioruptor-非接触式超声破碎仪及小美超声-聚能式超声波DNA打断仪。此外,使用的实验材料为浓度为160ng/μL的全基因组DNA溶液。

实验步骤:

  1. 提前15分钟启动三款仪器的冷水机,将温度设置为4℃。
  2. 在每个爱思进品牌的15mL EP管中加入100μL的全基因组DNA溶液,浓度为160ng/μL。
  3. 把装好样品的15mL EP管放入对应的仪器适配器中,其余空位用相同体积的水装满。
  4. 程序设置:温度4℃,超声工作时间20秒,间隔时间10秒,总时长设置为15分钟和20分钟,进行两个梯度的比较。
  5. 程序结束后,取出样品并使用毛细管电泳检测基因组片段化情况。

实验结果:

  • 小美超声-高通量声波基因组剪切仪
    ① 设置:温度4℃,超声工作时间20秒,间隔时间10秒,总时长15分钟,平均片段大小3100bp。
    ② 设置:温度4℃,超声工作时间20秒,间隔时间10秒,总时长20分钟,平均片段大小3001bp。
  • bioruptor-非接触式超声破碎仪
    ① 设置:温度4℃,超声工作时间20秒,间隔时间10秒,总时长15分钟,平均片段大小4329bp。
    ② 设置:温度4℃,超声工作时间20秒,间隔时间10秒,总时长20分钟,平均片段大小4058bp。
  • 小美超声-聚能式超声波DNA打断仪
    ① 设置:温度4℃,超声工作时间20秒,间隔时间10秒,总时长15分钟,平均片段大小3655bp。
    ② 设置:温度4℃,超声工作时间20秒,间隔时间10秒,总时长20分钟,平均片段大小3881bp。

根据实验结果汇总可知,人生就是博-尊龙凯时在均一性方面表现较为突出。在样品和程序设定等条件相同的情况下,bioruptor的非接触式超声破碎仪和小美超声的聚能式超声波DNA打断仪的200-500bp片段占比分别达到58.3%和65.4%,且二者的峰图呈陡坡状,反映出基因组片段的均一性较差。相比之下,小美超声的高通量声波基因组剪切仪在相同区间的占比达到64.7%,并形成平缓的峰图,表明其基因组片段化均一性优于前两者。