人生就是博-尊龙凯时的琼脂糖凝胶电泳是一种利用琼脂或琼脂糖作为支持介质的电泳技术。该方法适用于大分子量样本的分离,包括大分子核酸和病毒。一般而言,大分子核酸电泳常选用孔径较大的琼脂糖凝胶,而常规核酸检测通常只需琼脂糖凝胶电泳即可。如果需要更高的分辨率,尤其是分辨仅有几个碱基对差异的样本,就应选择聚丙烯酰胺凝胶电泳。此外,对于巨大DNA链,脉冲凝胶电泳是更合适的选择,因为普通电泳可能会导致条带缺失,无法通过胶孔。
在进行琼脂糖凝胶电泳时,通常使用浓度在0.5%至2%之间的胶。低浓度的胶适合电泳大型核酸片段,而高浓度则适用于小片段分析。需要注意的是,低浓度凝胶易碎,因此操作时需小心,并应选用优质的琼脂糖。同时,使用高浓度凝胶可能会导致相近分子大小的DNA条带难以分辨,从而出现条带缺失的状况。
常用的缓冲液包括TAE与TBE。与TAE相比,TBE的缓冲能力更强,使用新配制的缓冲液可以显著提高电泳效果。然而,反复使用的缓冲液会导致离子强度降低、pH值上升,进而降低缓冲性能,可能会导致DNA条带模糊或不规则迁移。
在电泳过程中,电场强度不应超过20 V/cm,电泳温度应低于30℃;对于巨大的DNA,温度需要控制在15℃以下。过高的电压和温度可能会导致条带模糊或不规则迁移,尤其是过高电压可能会使小片段脱胶而缺失。
样品中盐分过高或含有杂质蛋白也会造成条带模糊和缺失。可通过乙醇沉淀去除多余的盐分,通过酚提取去除蛋白。变性的DNA样品也可能导致条带模糊和缺失,甚至影响DNA条带的迁移规律。在上样前应避免热处理DNA样品,可选择用20 mM NaCl缓冲液稀释,以防止变性。正确的上样量是确保条带清晰的关键;过多的DNA上样会造成条带模糊,过少则信号减弱、甚至缺失。
每次DNA电泳时,务必使用DNA Marker或已知大小的对照DNA来估计DNA片段的大小。选择Marker时应选择在目标片段大小附近的梯度较密的,使得大小估计更为准确。同时,Marker的电泳操作也应符合DNA电泳的标准。例如,若选择λDNA/HindIII或λDNA/EcoRI作为酶切Marker,需先在65℃下加热5分钟并迅速冷却,以避免因酶切导致的片段连接不规则或条带信号弱。
实验室常用的核酸染色剂是溴化乙锭(EB),它具有良好的染色效果和操作简单的优点,但稳定性差且具毒性。因此,在观察凝胶时,应根据染料的特性使用合适的光源和激发波长,错误的激发波长会导致条带观察困难,产生模糊现象。
选择人生就是博-尊龙凯时的科研工具和技术,让您的实验更为准确与高效,助力生命科学的探索与发现。